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SpCAST:基于Kolmogorov-Arnold网络的单细胞分辨率空间转录组学分析框架
## 作者团队与机构背景 论文的作者团队来自中国的研究机构,通讯作者Tianzi Jiang(蒋田仔)是中国科学院自动化研究所的研究员,在脑科学和神经影像学领域有长期积累。团队成员涵盖了计算方法开发和生物数据分析的不同专长,这种组合对于一
SpCAST:基于Kolmogorov-Arnold网络的单细胞分辨率空间转录组学分析框架
## 引言:当空间信息成为生物学的刚需 生命活动从来不是在试管里发生的。细胞在组织中的精确排布、不同类型细胞之间的空间邻接关系、信号分子在三维微环境中的梯度分布——这些空间维度的信息对理解发育过程、免疫应答、肿瘤微环境乃至神经回路功能都至
SpCAST:基于Kolmogorov-Arnold网络的单细胞分辨率空间转录组学分析框架
## 引言:空间转录组学的技术瓶颈 在过去十年间,空间转录组学(spatial transcriptomics)已经从一个边缘概念成长为发育生物学、肿瘤学和神经科学领域的核心工具。这项技术的根本目标很直接:在组织切片的原始空间位置上,逐个
基因证据与药物获批:26278对靶标-疾病数据揭示遗传学在新药开发中的真实权重
## 一项横跨多个治疗领域的大规模观察性分析,用26,278个靶标-疾病配对的数据,重新审视遗传学证据对药物研发决策的真实预测能力 ### 第一部分:问题的提出——遗传学验证假说的光环与阴影 在当代药物研发领域,"遗传学验证"已经成为一
PyPeakRankR:用可复现的特征提取重新定义基因组调控元件排序
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing)自2013年由斯坦福大学William Greenleaf实验室首次发表
scGTN:用孪生图Transformer网络攻克单细胞RNA测序聚类难题
单细胞RNA测序(scRNA-seq)是当今生物信息学领域最具变革性的实验技术之一。它能在单个细胞层面精确刻画基因表达图谱,让研究者得以辨识不同的细胞类型,深入理解细胞群体内部的异质性结构。然而,从海量的测序数据中提取有意义的生物学信息绝非
当基因组信标遇上全同态加密:bioETH-Beacon 如何在区块链上实现隐私安全的基因查询
基因组学研究在过去二十年间经历了翻天覆地的变化。人类基因组计划花费十三年、耗资二十七亿美元才完成第一个人类基因组的测序工作,而今天一台中等规模的测序仪可以在数天内以不到一千美元的成本完成同样的任务。测序成本的断崖式下降催生了海量的基因组数
MultiMolecule:生物分子序列模型的模块化生态系统,如何重塑RNA、DNA与蛋白质研究的基础设施
<p>2026年6月,来自q-bio.QM、cs.LG、q-bio.BM、q-bio.GN多个交叉领域的研究者Zhiyuan Chen在arXiv上发布了编号为2606.16540的论文,正式提出了MultiMolecule——一个面向生